2259年初，約翰·謝里丹上尉接替辛克萊擔(dān)任空間站的軍事長(zhǎng)官。他和指揮人員得知，圣地亞哥總統(tǒng)之死實(shí)際上是由副總統(tǒng)克拉克（圣地亞哥死后繼任總統(tǒng)）策劃的暗殺。巴比倫五號(hào)指揮人員與靈能軍團(tuán)之間爆發(fā)了沖突。靈能軍團(tuán)是一個(gè)日益專(zhuān)制的組織，負(fù)責(zé)監(jiān)督和控制人類(lèi)心靈感應(yīng)者的生活?？臻g站的副指揮官伊萬(wàn)諾娃指揮官其實(shí)是一名潛在的心靈感應(yīng)者，但她一直非法逃避在靈能軍團(tuán)的登記。